固相合成多肽裂解及側鏈保護基脫除
Fmoc法裂解和脫側鏈保護基時可(固相合成多肽)采用弱酸.TFA為應用*廣泛的弱酸試劑，它可以脫除t-Bu、Boc、Adoc、Mtr等；條件溫和、副反應較少.不足之處：Arg側鏈的Mtr很難脫除，TFA用量較大；無法除掉Cys的t-Bu等基因.也有采用強酸脫保護的方法：如用HF來脫除一些對弱酸穩定的保護基，如Asp、Glu、Ser、Thr的Bzl(芐基)保護基等，但是當脫除Asp的吸電子保護基時，會引起環化副反應.而TMSBr和TMSOTf在有苯甲硫醚存在時，脫保護速度很快.此外，根據條件不同，堿、光解、氟離子和氫解等脫保護方法也有應用.
固相合成法(固相合成多肽)對于肽合成的顯著的優點：簡化并加速了多步驟的合成；因反應在一簡單反應器皿中便可進行，可避免因手工操作和物料重復轉移而產生的損失；固相載體共價相聯的肽鏈處于適宜的物理狀態，可通過快速的抽濾、洗滌未完成中間的純化，避免了液相肽合成中冗長的重結晶或分柱步驟，可避免中間體分離純化時大量的損失；使用過量反應物，迫使個別反應完全，以便*終產物得到高產率；增加溶劑化，減少中間的產物聚焦；固相載體上肽鏈和輕度交聯的聚合鏈緊密相混，彼此產生一種相互的溶劑效應，這對肽自聚集熱力學不利而對反應適宜。固相合成的主要存在問題是固相載體上中間體雜肽無法分離，這樣造成*終產物的純度不如液相合成物，必需通過可靠的分離手段純化。
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